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南方科技大学2021在全国本科院校排名第208位，强于第209名的曲阜师范大学，第210名的三峡大学，第211名的南京艺术学院，第212名的河南农业大学，第213名的河北农业大学。在广东排第12名，强于第13名的广州中医药大学，第14名的广州医科大学，第15名的广东财经大学，第16名的广东海洋大学，第17名的广东技术师范大学。
| 竞争力排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 208 | 南方科技大学 | 广东 | 12 |
| 2020 | 212 | 南方科技大学 | 广东 | 12 |
| 2019 | 217 | 南方科技大学 | 广东 | 12 |
| 2018 | 290 | 南方科技大学 | 广东 | 15 |
| 2015 | 802 | 南方科技大学 | 广东 | 39 |
综合实力排名（校友会版）
南方科技大学2021在全国本科院校排名第131位，强于第132名的山东财经大学，第132名的安徽农业大学，第132名的华北电力大学，第135名的云南民族大学，第135名的长沙理工大学。在广东排第9名，强于第10名的广州大学，第11名的东莞理工学院，第12名的汕头大学，第13名的广东财经大学，第14名的广东海洋大学。
| 校友会排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 131 | 南方科技大学 | 广东 | 9 |
| 2020 | 115 | 南方科技大学 | 广东 | 10 |
| 2019 | 176 | 南方科技大学 | 广东 | 12 |
综合实力排名（软科版）
南方科技大学2021在全国本科院校排名第41位，强于第42名的华中农业大学，第43名的上海大学，第44名的苏州大学，第45名的华东理工大学，第46名的华中师范大学。在广东排第3名，强于第4名的暨南大学，第5名的深圳大学，第6名的华南师范大学，第7名的华南农业大学，第8名的广州大学。
| 软科排名 | ||||
| 年份 | 全国本科排名 | 院校名称 | 省份 | 省内排名 |
| 2021 | 41 | 南方科技大学 | 广东 | 3 |
| 2020 | 46 | 南方科技大学 | 广东 | 3 |
| 2018 | 43 | 南方科技大学 | 广东 | 3 |
